Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRSK1Q8TDC3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms