Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SVOPQ8N4V2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms