Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP1Q8N474 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms