Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPAP2Q8IXW5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms