Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMB4Q86W47 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms