Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2Q1Q7Z7E8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms