Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms