Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q71RC1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q71RC1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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