Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP53Q70EK8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP53Q70EK8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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