Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAF7Q6Q0C0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF7Q6Q0C0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms