Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6P435 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q6P435 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q6P435 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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