Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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