Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms