Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KHDC3LQ587J8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms