Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PKDCCQ504Y2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms