Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWISTNBQ3B726 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms