Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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