Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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NCOA1Q15788 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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