Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms