Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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