Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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