Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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