Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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