Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms