Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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