Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL157902.2-201ENST00000623435 1492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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MKRN4PQ13434 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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