Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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