Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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NME3Q13232 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME3Q13232 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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