Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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IFT88Q13099 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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