Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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