Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms