Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms