Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms