Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6Q03468 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms