Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms