Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms