Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFITM3Q01628 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms