Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms