Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FAM3AP98173 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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