Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMF1P82094 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMF1P82094 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMF1P82094 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms