Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPNP63162 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms