Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms