Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCBP4P57723 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms