Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDH15P55291 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDH15P55291 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH15P55291 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH15P55291 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms