Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP12AP54707 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP12AP54707 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP12AP54707 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms