Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN1P49768 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms