Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms