Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PXNP49023 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PXNP49023 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PXNP49023 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PXNP49023 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms