Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HPCAL1P37235 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms