Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms